Может ли Я.Директ негативно влияеть на позиции?

влияет как в плюс так и в минус. неважно как хорошо ты отфильтруешь слова, я за несколько лет работы ежедневной в директе для своего магазина отфильтровал все инфо запросы, непродающиеся у меня бренды, запросы когда ищут конкурентов - все для того, чтобы свести ненужный трафик на нет полностью. У меня это получилось, реально из 100 запросов в лучшем случае десяток будет ненужная фраза, а то и того меньше. Все это сделано не просто чтобы не потерять деньги за клики, но и для того, чтобы не ухудшали ПФ. Но сейчас даже это не спасет тебя от склика и плохих как следствие ПФ на сайт. Сейчас мало того, что что плати что не плати продаж в директе нет, но в довесок тебе и ПФ так ухудшают, что  сайт проседает очень сильно.

Не рекламируюсь больше 2 месяцев вообще

У нас группа предпринимателей объединились в местный негласный клуб в это нестабильное время, чтобы хотя бы в сезон продаж не вставлять палки в колеса друг другу (как это обычно бывает).
Решили скорректировать цены на свои товары, чтобы не было обидно никому, а конкурировать между собой только сервисом.
Провели ряд консультаций и нашли довольно неплохое решение со складами и прочими рабочими процессами на время пандемии и других факторов, влияющих на бюджеты наших магазинов.
Решили, что откажемся от рекламы в Директе не потому что проседают позиции (не проседают), а потому, что идет дикий склик бюджета и со стороны Яндекса вообще никаких внятных ответов на этот счет не последовало.
В гугле тоже есть такое явление, но там хотя бы окупается это все. Да, отработать там стоит еще глубже и лучше (чем сейчас и занят).
Решил, что в 2021 полностью уйду в соц.сети и буду развивать свой бренд.
В маркетплейсы уходить не вижу смысла (ЯМаркета вполне хватает, чтобы отдать "дань" Яндексу) - они рано или поздно сжирают бренд.

Пока так, возможно, пересмотрим свои решения, но в ближайшие месяцы выгоднее работать в сговоре.

завидую по белому вам, сделать в нашем регионе даже не представляю возможным такое причем чтобы все участвовали. Маркетплейся для не производителей или импортеров это утопия, сами себе же роют могилу, растят конкурента которого не подвинешь потом никак, причем за свои же деньги. Причем на маркетплейсах никогда ты не заработаешь тем более в долгосрок.

ЯМаркет дал мне 3,65% конверсии.
Заработать можно на нем, но цель продвинуть свой бренд (как интернет-магазин), а не сидеть на игле Директа/Маркета (хотя не "кормить" Яндекс невозможно - не даст роста позиций в краткосрочной перспективе).
Все зависит от товарной матрицы, сервиса, скорости поставок самого товара и многих других факторов.

ЯМаркета вполне достаточно (возможно рассмотрим еще СберМаркет, когда он начнет нормальное сотрудничество). Без них, к сожалению, нет возможности здраво продавать в сети. Они уже, так сказать, откромленные монстры, которые воспринимаются как данность.

WB/Ozon/Ali - это, считаю, верный путь к похоронам бренда. У нас направление другое и нам просто не выгодно очернять идею грязными площадками.

В Гугл не заходил далеко (скорее всего - это стратегическая ошибка, которую нужно будет решать в 2021).
Повторюсь, буду заходить в соц.сети, посмотрю на выхлоп за эквивалентные бюджеты в Директ.

Каким образом у вас это повлияло?

После отключения РК на ЯД позиции с топа падали и не раз это заметил! Не которые группы товаров наоборот после запуска РК на ЯД поднялись в топ через пару месяцев. 

яндекс маркет и Беру он же покупки яндекс маркет разные вещи. на первом норм хотя их поддержка качества просто ад, второй это тот же озон и ВБ , все равно что иди работать по найму к ним

значит ПФ в директе у тебя норм были, склика мало, у меня же наоборот, зашел туда = нет продаж и нет денег уже там, в органике совсем другое.

Все зависит только от тематики и не зависит от «бойкотов» и «предубеждений» пользователей. В большинстве тематик – «быстрые» продажи только в Директе и AdWords-е. В органике работают продажи «в долгую». В соцсетях (FB->Instagram) хорошо «продаются» игры-казино, луки-одежда, парфюмерия, любые поделки и подделки, товары без доставки, товары для здоровья, финансовое мошенничество.