Получается, что старая версия страницы (которая уже была в индексе) проверку этим алгоритмом проходила успешно, а новая версия (которая должна была заменить предыдущую) проверку не прошла. В итоге старую версию заменили на новую, но новую тут же исключили, потому что она не прошла проверку. Есть смысл задать Платонам этот вопрос - почему раньше страница проходила проверку алгоритмом успешно, а теперь не прошла? Если, конечно, вы никаких изменений на карточки товаров не вносили.
Они имеют ввиду, что этот алгоритм пытается предугадать, будет ли эта страница релевантной после её оценки основным алгоритмом. То есть, этот алгоритм предварительный - он решает, какие страницы можно сразу включить в индекс, а какие нужно проверить на вшивость основным алгоритмом. Вот ваши товары будут проверять на вшивость. Если вшей не обнаружится, то включат в поиск.
Главная страница переоптимизирована - https://yandex.ru/blog/webmaster/11464
Можно использовать вариант Б, просто не дублировать URL. Добавляете пельмени только в один раздел, а из остальных разделов делаете ссылку на этот рецепт.
Возможно, у главной страницы появились дубли в индексе. Или еще как вариант - переспам в анкор-листе.
Тут надо ответить на вопрос - а почему раньше было много прямых заходов? Кто вообще эти люди, которые к вам заходили напрямую?
Есть программа - http://parser.alaev.info/
Сервисов не знаю.
Не будет дублей, нормально будет влиять, если все делать правильно. Вот примеры:
http://remont-cars.ru/
http://www.psa-remont.ru/
Ну вот, например:
http://аренда-сайта.рф/catalog/
http://www.diol-it.ru/services/arenda_sites
http://site-naprokat.ru/katalog.html
Можно взять в аренду сайт с трафиком. Предложений - масса.
