Конечно, есть смысл. Другое дело, что это не является определяющим фактором.
А у вас и в самом деле на сайте почти 3000 страниц? Если их в реальности меньше, значит, в индексе полно всякого мусора и он по каким-то причинам уменьшается.
Это общее число проиндексированных страниц.
Если поддоменам присвоен правильный регион в Яндекс.Вебмастере, то они не должны мешать друг другу при поиске из разных городов. Насчет https - я думаю, это не имеет значения.
Можете тут посмотреть - /ru/forum/optimizators-exchange/exchange-purchase-sale-links
Или работать по части естественных ссылок:
https://events.yandex.ru/lib/talks/3264/
https://events.yandex.ru/lib/talks/3297/
https://events.yandex.ru/lib/talks/3261/
Или вот некоторые умудряются обойтись без ссылок - /ru/forum/comment/14973028
Скорее всего, ссылок мало. Попробуйте сравнить объем ссылок у себя и у конкурентов.
А как обстоят дела со ссылочной массой?
plosha, на такой случай есть инструкция - https://yandex.ru/support/webmaster/yandex-indexing/moving-site.xml
Проблема с Яндексом или с Гуглом? Если с Яндексом, то просто добавляете каждый поддомен в вебмастер и присваиваете нужный город.
NOTBAD, проблема в полупустых страницах типа:
http://beamng-drive.com/2016/09/19/
http://beamng-drive.com/2017/02/01/
и т. д.
Надо их или наполнить контентом, или закрыть от индексации, или вообще удалить.