Проверяйте кронтабы, просканьте rkhunter или chkrootkit, смотрите /etc/passwd на предмет лишних юзеров, пригласите админа.
Сделайте трассировку, будет видно где именно коннект обрывается хоть.
Для начала можете включить server-status
А у вас там случайно не включено catch-all email в директадмине?
Когда эта опция включена, то спам на любой *@domain.com сыпется на дефолтный ящик.
Подключите какой-нибудь репозиторий еще, http://dag.wieers.com/rpm/FAQ.php#B
там должно быть.
Для начала посмотрите netstat -an | grep 77, проверьте в ps ax запущен ли процесс панели.
Проверьте фаерволл, iptables -L
Если панель не запущена, то перезапустите её через service lxadmin restart (я не уверен что сервис называется именно так, точно можете посмотреть в /etc/init.d/).
А что это за лог? Это похоже на error_log апача, он к неймеду отношения не имеет, смотрите в /var/log/messages почему не стартует named.
javascript включён в браузере?
В вашем случае пхп работает как модуль апача, тогда файлы всегда создаются от апача.
Если у вас свой вдс, можно suphp, пхп как cgi, или apache-mpm-itk, чтобы файлы создавались от юзера,
но если у вас какая-то панель на вдс, то далеко не каждая позволит такое сделать просто.
через .htacccess по HTTP_REFERER
RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_REFERER} !^http://(www\\.)?yoursite\\.com [NC]
RewriteRule \.([Gg][Ii][Ff]|[Jj][Pp][Gg])$ - [F]