Руками проверять сотни запросов замучаетесь, используйте любой бесплатный софт типа серп парсера
Поставьте в вебмастере регион Екатеринбург, это очень поможет. Можно для верности написать в поддержку яндекса и попросить ускорить процесс, у них хорошая и быстрая поддержка. Это поможет.
Попросите любого программиста написать элементарный скрипт. Делов на полчаса
На выдачу никак не влияет, а вот на юзабилити ещё как, если дизайн не раздражает, человек остается. Плюс желательно использовать белые и светло-зеленые тона, успокаивающие.
Покупка категорически нет
Размещение естественных - однозначно да и только в плюс.
Скорее всего купили дропнутый домен, либо это бывший дорвей и старые ссылки ещё не слетели, то что домен старый с одной стороны плюс, но то, что там висели дор не очень хорошо. Смотрите через архивы - как давно там был дорвей, если прошло хотя бы 2 года, можно не переживать.
Если это интернет-магазин, упор сделайте на карточки товаров и конкретно на "С этим покупают/смотрят"
+ остальная перелинковка актуальна только тогда, когда сами ссылки внутри страницы кликабельны, тогда она будет иметь вес, если люди не будут на них клацать - убирайте.
Не нужно вообще пользоваться автоматическими биржами - это чудесный и самый быстрый способ похоронить сайт
Однозначно лучше на поддомены, если бы один город был, в яндекс вебмастере установили бы регион и всё.
Нет, не правильно. Ставьте редирект