Что бы не задавать себе в будущем вопроса, а может это именно виджет влияет на позиции...? ))
Переопределите на div или что вам подходит.
Любой барчик типо такого https://wordpress.org/plugins/hashbar-wp-notification-bar/
Их масса в репо wp, есть по проще.
Если вы перешли на новый алл сео, то фильтры в нем поменялись и используемый вами, теперь вот так будет aioseo_canonical_url
Судя по всему вам не очень хочется поменять или найти все в базе через phpMyAdmin.
Тогда попробуйте вот этот плагин или похожие Better Search Replace.
Для древних и не обновляющихся с давних времен хостингов, написана функция, когда "деревья были большими". Не думаю, что такие есть сейчас.
Ни как не повлияет, в wp не только версия расскажет все про него. Но скрыть можно.
Протестируйте.
