Ну сохранённые копии страниц хотя бы проверьте.
Всё ли на месте? Всё ли в индексе?
Одно дело "продвинуть в топ", другое "сделать сайт витальным по запросу и прибить к топу".
Первое нереально даже со знанием параметров - без знания, как они учитываются для данного запроса.
А второе, подозреваю, бывшим сотрудникам не доступно.
Те, кто пишут не для галочки, обычно делают это за деньги.
У вас немного не тот подход. Попробуйте довести свой сайт до идеала отдельно в каждом известном вам пункте ранжирования.
И приходите с вопросом "чего я не знаю? Всё идеально, но вот они выше".
Сравнивать два плохих сайта с подходом "у меня чуть менее плохое" бессмысленно. Слишком много спорных факторов и их сочетаний.
https://feedback.yandex.ru/webmaster/
Я думаю, тут всем интересно, что ж вы там такого делали-то?
Яндекс постоянно тестирует новые форматы выдачи на небольших группах пользователей.
Возможно, что-то сломали в такой вот тестовой выдаче. Или так и задумано.
Быдлооптимизаторы - это те, которые говорят "стучать" вместо хотя бы "жаловаться".
А белые сейчас только те, которые работают в абсолютно неконкурентных тематиках.
Или с ультратрастовыми ресурсами.
Но это не отменяет того, что дорвейщики - на другом краю сей цветовой дифференциации, в самом конце.
Это вопрос к битрикс-программерам на самом деле.
Можно ли вкрутить костыли в модуль "крошек" так, чтобы для конкретных урлов доп.навигация формировалась не по общим правилам.
rel="canonical"?
Не совсем структура, но задачу в теории решит.
Исправил.
Вообще - время покажет. Яндекс имхо имеет возможности для перетаскивания немалой части коммерческой и информационной выдачи в свои "Острова", но дело это долгое и муторное.
Да, я выше дополнил как раз в таком духе.
Есть ещё крайне полезная штука Xenu.
Хотя программка и не предназначена впрямую для поиска дублей, но данных собирает достаточно для частичного решения задачи.