Вы имеете закрывать в nofollow закрывать? Это без толку (сто раз обсуждалось), ибо вес уйдёт, но никуда не придёт. Что касается количества внутренних ссылок с главной, то тут учитывайте свою стратегию продвижения, если двигаете исключительно морду (редко, но бывает), то с неё минимум, на неё максимум ссылок, если внутряк, то и ставьте беки на продвигаемые разделы или страницы.
Это из разряда "хочу быстрее ездить, получится ли, если куплю другую машину?" Смотря что на что поменяете.
Желательно предлагать точно то, чего нет - были нетбуки - надо их и предлагать + регион смотрится спамно + если так сделать на 100500 страницах, то кроме минуса ничего не будет.
Дубль на дубле сидит и дублем погоняет - с robots.txt поработайте + для этого компоненты есть для Joomla + в h1 - h2 надо не лого и фото, а заголовки оформлять + карта сайте где? + уникальность. Работать и работать - начните с этого.
Может не работает не из-за разбавки nofollow, а из-за недостаточного качества остальных открытых ссылок?
Нет никакой песочинцы в таком понимании как у Google (исключаю ВЧ) просто траф по НЧ и СЧ СК зависит не только от оптимизации и ценности отдельной страницы, но и от траста самого сайта, а он при правильной раскрутке со временем растёт. Отсюда и вывод - от того как продвигаете и каков из себя сам сайт и зависит траф.
Была та же проблема, вроде как решилась переносом сайтов на новый сервер. После переноса прошло 3 месяца - один сбой был минут на 20, а до этого раз в неделю часа на полтора. Повезло? Или до этого не везло?
Структура сайта в глазах ПС такая же как и в глазах пользователя (не индексирует не значит не видит), чел. просто выбрал стратегию продвижения материалов и сделал всё правильно для этого. Не нужны теперь ему ссылки, он за счёт контента и перелинковки берёт трафик.
А что вам nofollow? Так вес уйти - уйдёт, но не передастся на главную. Нужно отключать показ главной в меню и лого на внутряке.
В Google, возможно, через пару недель (а-ля Пингвин 2.1) поменяетесь местами.