Так много может быть причин. Фильтры разные бывают, хостинг отказывает, ссылки выпадают, апдейты происходят, санкции накладываются, Я глючит и т.п.
На самые посещаемые поставить 301 редирект. На самые частые в поиске и на те, на которые ведут ссылки - тоже самое. На остальное забить.
Серверные логи.
Панель Вебмастера.
Тоже интересно, что это? Сервис накрутки показов рекламы и ПФ?
Если сайт в ЯК, то можно запросить смену региона:
https://yandex.ru/support/catalogue/troubleshooting/incorrect-region.html
Как правило ее делают, если есть живой филиал.
ИМХО регионы надо выбирать те, где больше целевая аудитория. Т.е. стоит поменять регион на СПб.
Покупать с хороших не достаточно. Они потом когда-то становятся плохими. Тогда надо быстро снимать.
Значит, не закрыты. от индексирования. Ошибки в роботсе ищите.
Используйте тег каноникал. На комментариях тоже. На результатах поиска еще поставьте тег noindex.
Проверить качество площадок и страниц доноров. Удалить некачественные. В первую очередь проверять те, что показаны в Вебмастере. Проверять регулярно. Докупать взамен на качественных.
А оно в Я бывает логичным? ИМХО, задача сейчас так не стоит, задача стоит попасть в топ вопреки нелогичному ранжированию. 🤪
Есть соображение, что получите бан за накрутку поведенческих.