Яндекс все сделал правильно, исправлять выйдет дольше и дороже. Делайте новый сайт для людей - читайте рекомендации яндекса.
Я бытовую технику в васко покупал ( холодильник, стиралку ), правда с доставкой.
У них все окей с этим, привозят и приносят ( за доп плату ) в квартиру, распечатывают и проверяем, если меня все устраивает то оплачиваю.
Яндекс раздает страницам региональность, видимо из за этого штормит.
Это еще надо проверять, может вебмастер сам и не ставил ссылки но другие ставили. У ТС например на сайт доры ссылались, был подьем, потом часть или все их забанили ( соломоно некоторые до сих пор показывает ) и ссылки отпали, вот и падение.
Думается есть смысл проверить ПФ, перед взлетом, на вершине взлета и сразу после падения. Возможно Яндекс так проверяет интересен ли сайт пользователям.
Есть несколько вариантов, только не со 100 % гарантией что яндекс присвоит город ( Пробовал в Московской области по городам ).
Уникальный контент хоть на поддомене, хоть на домене это конечно лучше.
Регион можно присвоить хоть поддомену, хоть отдельной странице на сайте ( по стране не проверял, но по городам области можно ).
Ну вы блин даете, сейчас исправлю на хорошее.
Есть вопросы. Откуда бралось ссылочное, тематика сайта, сайт новостной.
Если не боитесь, киньте урл в личку, посмотрю, может взгляд со стороны что то выявит.