Все сильно зависит от перелинковки. если она сделана соответствующие, то и вес передаваться будет.
Если бюджет позволяет - оставьте ссылки на главной, закупайтесь постепенно на внутряки. Если поджимает, постепенно снимайте с главной, но какую-ту часть лучше оставить.
Что касаемо яндекса - он намного приличнее. Недавно прикинул как я пользуюсь яндексом.
Когда я просыпаюсь - смотрю погоду в яндексе, когда еду на работу - поглядываю в яндекс пробки. Приехав на работу, похлебывая кофе, почитываю яндекс новости и блоги. Пока работаю - в ухи орет Slipknot с яндекс.музыки. Когда вечерком доползаю до зомбоящика - программка в яндексе. Когда нужно что-то прикупить электронное - открываю я.маркет, там удобные фильтры поиска. Когда нужно куда-то добраться - смотрю я.карты (ну не хочет гугл Ростов-на-Дону на карты наносить). Ну, и почта у яши. Когда пользуюсь поиском - это яндекс, потому как региональный поиск гугла с большими приключениями...
Вопрос - вы реально думаете, что меня, как пользователя, волнует, что поисковая база яндекса обновляется чуть медленней и в ней чуть-больше застоявшихся сайтов? Да насрать.
Яндекс рвал, рвет и будет рвать гугл, пока тот за ум не возьмется. Гугл для снобов и гиков, иногда для поиска технической информации (и то редко). А то, что в яндексе продвигать сложнее - так это не проблемы яндекса.
