А Вы при этом root?
id что скажет?
Создавали папку site1 от root'а наверное?
Соответсвенно у Вашего FTP-пользователя user нету прав туда писать.
chown -R user:user /home/user/site1 в консоли должен проблему с записью в эту директорию решить.
Хотел бы заметить, что при своей быстроте Химик делает еще и качественно, проблем после него не возникает. А давая человеку (про которого Вы скорее всего ничего не знаете) такую характеристику, Вы сами себя характеризуете не с самой лучшей стороны. Уверен, объяснение быстроты может лежать далеко за пределами финансовых интересов.
Боюсь теперь, я не стал бы обращаться к Вам за услугами, даже принимая во внимание объявленную Вами акцию и Ваш титул самого злобного и упертого админа в разделе на SE.
Все-таки, как мне кажется, иметь свой договор в подобных случаях лучше. По крайней мере потенциальный партнер будет примерно представлять на каких условиях согласен работать админ-фрилансер.
Условия естественно обсуждаются в каждом конкретном случае, но заявить свои умолчальные никогда не помешает. Если своих юридических знаний не хватает, а их больше чем у половины страны не хватает можно к юристу за консультацией обратиться, думаю выйдет не так дорого, как могут обойтись возможные убытки из-за проблем на сервере такого как ТС клиента.
Да и при повседневной мелкой работе оговорить условия тоже неплохо, проблем в будущем меньше будет.
По поводу странностей директадмина поддерживаю предыдущего оратора, поскольку тоже имел счастье удалять его с сервера, мне правда повезло больше, я в итоге владельца сервера на переустановку ОС уговорил.
А вот зачем собирать php на пакетном дистре, я тоже не особо понимаю. Ну ладно экзотику какую-нибудь, которую в пакетах не найти, но php.
Для начала можно закрыть исходящие SSH соединения и посмотреть ломится ли кто-то от Вас сейчас наружу на 22 порт. Соответсвенно и хостеру сказать что исходящие SSH закрыли, чтобы они отрапортовали о победе над абузой. Если кто-то ломится искать кто. Скорее всего куда-то залили какую-нибудь брутилку и запустили.
Сносить из-за этого систему я бы не стал.
В этом случае конечно будет.
На всякий случай проверил, вдруг ошибаюсь...
Отключил в apache ведение access.log, обращения в скриптам теперь в логе не отражаются.
А зачем с apache логирование убирать? Апач же скрипты обрабытывает, тогда обращения к ним нигде не учтутся.
Как-то искал сервер в KVM (ну потерялся он), листаю значит сижу и тут вдруг окошко как распахнулось и черное все а потом проявилась надпись Welcome и гномовский логин-менеджер. Испугался, так и не понял зачем оно на сервере.