1. Выкатите новый сайт на новом домене
2. Пропишите на старом сайте Host: новый-домен.ру
3. Можно еще в Яндекс.Вебмастере старого сайта явно указать новое зеркало
4. Подождите, пока Яндекс его переклеит на новое зеркало (месяц примерно; если так и не переклеит, то переходите к след.пункту)
5. Поставьте 301-е редиректы со всех страниц старого сайта на соответствующие страницы нового.
6. Старый сайт лучше не отключать никогда, чтобы эти 301-е редиректы продолжали работать. Так вес старых ссылок перейдет на новый сайт, вы сохраните PR, ТИЦ, фигиц и все остальное.
Все зависит от того, какие языковые версии вы будете двигать и какими силами.
Насколько приоритетной будет русская версия.
Линк alternate - это понятно и обязательно надо так сделать.
В Я.Каталог будете добавлять? Если да, то можно будет назначить регион Россия отдельной подпапке /ru. И тогда можно двигать вариант 2 или 3 - статический ссыл.вес будет накапливаться за счет всех ссылок на домен.
1) да
2) Лучше не закрыть от индексации, а приклеить каноникалами.