С помощью LoginGraceTime и MaxStartups можно попробовать воспроизвести эту ситуацию. Но это все лирика и гадание на гуще.
Запустите sshd в режиме отладки, добейтесь повторения ситуации и посмотрите время по серверу.
Соберите логи за это время и выложите сюда через pastebin.
Тогда поможем.
А почему в мире так много криминала?
Потому что мало красивых женщин шаговой доступности. Вот мужики и серчают.
Впрочем, это тема уже другого форума.
Возвращаясь к проблеме - ставьте fail2ban и отправляйте все подозрительные IP в черный список.
http://www.gluster.org/pipermail/gluster-users/2008-July/000100.html
Ну почему же, если у ТС куча денег, то он вполне может наказать злодея.
Пользуйтесь кроном
Советую переустановить сервер начисто. Мало ли чего там понапихали.
vzctl set $VEID --capability sys_admin:on vzctl set $VEID --devices c:10:229:rw --save vzctl exec $VEID mknod /dev/fuse c 10 229
Особо никак не скажется, так как вся производительность упрется в сам php скрипт
Поставить обработчик 404 ошибки
Советую обновлять LTS на LTS.