Ну и нечего волноваться. Будут ссылки, все будет.
Cossack, полностью поддерживаю. Конечно, в каждой семье не без уродов. Но уж поисковики тут запросто переплевывают оптимизаторов по "качеству" показываемых на первой странице сайтов.
Почему на "раскручиваемый проект" больше нет ссылок? Хотите раскрутить, а потом обратно скрутить ? :)
Зачем передергивать? Чтобы понять основные принципы работы алгоритма, статьи хватит.
Ergo, теперь понятно, почему у вас так много вопросов про ссылки. Перечитайте внимательно статью "Растолкованный PageRank" в семи частях. Там ни разу не встречается слово "домен", только "страницы".
И не путайте PR с Яндексовским бывшим ИЦ, а теперь тИЦ.
SSI - это механизм HTTP-сервера. Любой HTTP-клиент (в том числе робот поисковой машины) получает готовый результат.
P.S. только странно, что у вас у включаемого файла расширение .shtml. Он еще кого-то будет включать?
Зачем все с главной? Ставьте с других страниц тоже.
Перераспределить. Почему миф?
Подумать головой. Вам намекнули на цифру 404 постом выше. Вот вокруг нее и шуруйте. Переиндексация в Яндексе, если его попросить, займет ну дней 10. Все страницы можно поудалять руками, а новые засабмитить.
Но, глянув в код, я бы их сначала поправил.
Сильно зависит от темы. Несколько десятков - конечно можно. Чем интереснее сайт, тем больше.