Ждать, конечно, надо.
А вот за /links.html могли бы и выкинуть нахрен все страницы, чтобы неповадно было.
"У нас известная фирма, мы 15 лет обменивались ссылками на этой странице" :).
(из выступления из зала на ноябрьской конференции)
А может быть надо сначала для себя решить, каков адрес первой страницы - site.ru/ или site.ru/index.php ? И использовать везде только его. Иначе могут возникнуть непонятки с дубликатами.
Если хотите усложнить задачу поисковой системе, то делайте всевозможные адреса. Можно удвоить число вариантов, если добавить www впереди, и еще удвоить, если не ставить слеш после site.ru.
Но лучше этого не делать.
Удобно следить за логами на старом хосте. Обычно за 2-3 дня заходы полностью прекращаются, в том числе и ботов.
Если критерий может соврать в одном места в 100 раз, а в другом всего в 1.5, то я бы не считал это критерием.
Спросите в Google: define:nautical mile
Что вы имеете в виду под словом "рейтинг сайта" ?
Попробуйте убрать "опцию", т.е. редирект.
А также отсутствие всевозможных других ошибок типа сессий, дублей, редиректов, особенно на главной странице и т.д. Можете посмотреть план аудита сайта - это что-то вроде подготовки сайта к продвижению. Если делать все пункты, мало не покажется.
https://www.google.com/webmasters/tools/ - там это есть.
