Задавался аналогичным вопросом /ru/forum/907025
В результате стал пользоваться Pyrus. Что могу сказать по истечение 3 недель - система пока полностью соответствует ожиданиям!:)
Гораздо проще и понятнее Megaplan и Bitrix24, которыми я пытался пользоваться. По вашим вопросам и то, что есть в Pyrus:
Обе эти функции есть и подзадачи реализованы так, что права доступа к ним ограничены. Плюс я также стал использовать проекты, где можно задать права доступа для любых пользователей индивидуально.
Счета можно создавать в самой системе через формы. По поводу интеграции - здесь не могу подсказать, но пишут, что интегрируется с любыми системами.
Пока пользовался бесплатно, но буду переходить на платную версию, т.к. уже 8 человек в системе и количество это растет стремительными темпами.
Тикеты настраиваются очень легко через отдельный проект и можно задать для них определенные маршруты.
В общем рекомендую попробовать. Я начал с бесплатной версии, благо, что она имеется.
Я имею ввиду, что мне не нужен комбайн все в одном, иначе что-то будет явно хромать. CRM отдельно, задачи и процессы отдельно. Соответственно нужна синхронизация. Мобильная версия важна. Насколько почитал отзывы у Megaplan она хромает. Восторгов Bitrix также не вызывает...