Вы можете сделать так - поместить все swf в одну папку и настроить там .htpasswd. С этой хреновней ни поисковик, ни человек туда не перейдут.
Если вы вернете сайт на старый домен и снимете редиректы, скорее всего позиции восстановятся.
Лучше с остальных страниц его убрать, оставить на той, куда пользователи попадают из поиска чаще всего. Еще вариант - сделать просто кнопку, которая будет заметна пользователю и перебросит его на нужную страницу с пояснением "о чем сайт".
