Нашел эту тему, так как у меня аналогичная проблема.
Сайт на Joomla 1.5 , грешил, что старая система но вижу проблема совсем в другом.
Хостинг украинский. Сайт заразили 26.08
Интересный момент, сайты с аналогичной проблемой, которые были описаны здесь располагаются в одном дата центре, как я понимаю.
Если верить 2ip.ru - провайдер проблемных сайтов Hetzner Online AG http://ru.hetzner.com/
IP конечно у всех разные. Пока соседей по IP не проверял.
Наши хостеры арендуют сервера в Hetzner Online AG ?, просветите, если ошибаюсь.
И гдето там в Германии и затаилась проблема, если да, то что-то ее медленно решают.