После внесения в ЯКа сайт упал в выдаче.

LIN, и как это Вы увязали принятие в каталог и тИЦ и выдачу :D

работайте над сайтом.

Связываю так как это произошло в течение 2-дней, до этого около полугода сайт занимал стабильную позицию (+\- 3).

Я не утверждаю, что эта взаимосвязь действительно есть, именно поэтому первый пост имеет вопросительный оттенок.

ADD. В региональной выдаче сайт остался в первой тройке (как и был).

Т.е. упала позиция только в общем серпе.