Почему Я-Метрика и Li.ru показывают разную статистику, кому верить?

Могу точно сказать что метрика больше ботов насчитывает чем ЛИ, хотя казалось метрика более продвинутая...

Когда на мой сайт заходило много посетителей с одного 1, то Li их считала за одного, а метрика как разных.

Каждая система считает по своему алгоритму. LI например в разделе по странам Крым считает как страну

Да и думаю LI это прошло, или ошибаюсь?

Там в LI помню курсы валют очень долго не обновлялись, с полгода наверно одни значения выводились. Думаю очевидно.
И если сайт еще в рейтинге участвует, то маркетологи/менеджеры и т.п. предложения шлют тематические через контакты на сайте.

Вполне возможно

Здесь на форуме уже писали, что боты как то специально обращались к яметртке непосредственно

Я предложил вполне рабочий вариант - поставить экспериментально еще один счетчик, это лучше чем гадать почему такая разница