Цели в Яндекс.Директе

Могу по советовать промежуточный вариант. Если есть сомнения в актуальности накопленных данных - можно, частично пробовать включать часть забракованных ранее площадок и отключенных объявлений, и смотреть какие у них показатели для новых целей. Если устраивают, оставлять работать, и пробовать включать часть других. Из вашего вопроса не сосем понятен ключевой момент, старые цели - они и раньше были не точными, или стали после изменений на сайте? Второй важный момент, в чём заключалась не точность, они определяли не тот этап воронки, или в принципе получены с погрешностью(например кривой коллтрекинг или клики по емейлу)?

Цель ранее была настроена так, что имела большую не точность. Она срабатывала когда в определенном месте на сайте зависание стрелки мыши более 2 сек - считалось цель отработала. Но как показывает аналитика - рядом находятся логотип и человек нажимая на него (для перехода на гл.стр.) мог просто спустить стрелку мыши вниз и случайно цель срабатывала. Сейчас цели другие и определяют точное действие (клик). Вот в чем разница.

Зачем кампанию перезапускать? Просто смиритесь, что n-ное время неправильно интерпретировали цель. У вас же есть прогнозный ROI кампании, ограничение стоимости цели в зависимости от условий бизнеса? А теперь есть и корректно настроенная цель.

В перезапуске кампаний есть свои плюсы и минусы, но такой повод тут рассматривать не нужно.

Тогда имеет смысл начать собирать статистику заново. Но опять же, как правильно написал wicker, это не повод начинать компании заново, включите удалённые площадки и выключенные объявления, полностью или поэтапно(как я писал ранее), и тестируйте с заново, для новых целей. Ну а в целом, это как Вам лично удобнее, если удобнее перенести - переносите, ничего в этом страшного не будет, так как прошлая статистика действительно была не очень некорректной, и имеет малую ценность.