Чисто SEO компаний в Томске нет, одиночки есть, но я ни одного не знаю :) Некоторые компании предлагают услуги по раскрутке, попутно с созданием сайтов, но об успешных кампаниях пока не слышно.
Из томских сайтов я бы добавил http://gorod.tomsk.ru -- развлекательный портал, на днях перевалил за 5000 хостов в сутки, для Томска этого много (в городе проживает около 500 тысяч людей, 10% являются пользователями интернета).
О томском интернете написано в Википедии:
http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D0%BE%D0%BD%D0%B5%D1%82
