[umka]

Скорее всего, просто удалить этот кусок будет недостаточно.

Нужно ещё и удалить там, где он вызывается.

Поищите по файлам вхождения "Get_links" и "get_remote".

Раз нет, то и славненько :) Напишите, когда появятся.

Подгружает и размещает на вашем сайте ссылки (скорее всего скрытые).

Если не рефспам, то, вероятно, такими текстовыми файликами метят заражённые сайты.

Если в логах чисто, то тут несколько вариантов:

1. Логи не настроены или настроены криво

2. Смóтрите не те логи или сообщение об ошибке выдаёт не апач

Тогда поделитесь директивами .htaccess для проверки человечности :)

Нет.......

Ааа… ну тогда конструкцию <Files>…</Files> нужно запихнуть в конфиг апача, только без <VirtualHost>…</VirtualHost>

Только мне показалось, что спрашивали про апач и .htaccess? :)

Добавьте в .htaccess в корне сайта:

<Files "xmlrpc.php">
Order allow,deny
Deny from all
Allow from ваш_IP
</Files>

Остаётся только посоветовать начать поиск администратора с прямыми руками, который сделает всё за вас:

/ru/forum/webmasters-jobs/websites-servers-administration

Без конкретной информации о характеристиках вашей системы, без статистики, логов, графиков, все советы будут бессмысленны.