Это естественно, раз сайты зеркальны (тоесть один из них фактически дублирует другой). Искаться будет только один из сайтов
эта тема уже обсуждается: 301-й редирект не перенес PR
общее мнение вобщем что переносить с помощью 301-го редиректа можно
в своё время и сам слил свои зеркала с помощью .htaccess, правда детального анализа этой операции не производил
