В Яндекс.Вебмастере в разделе Диагностика - Нарушения что-нибудь написано? Есть смысл выполнить вот этот список и написать Платону:
https://yandex.ru/support/webmaster-troubleshooting/rank.xml
Если уже он напишет, что с сайтом все ОК, то надо дальше думать.
Если убрать, то ссылки на старый URL перестанут передавать вес. А зачем его убирать-то? Разве он мешает?
Если страницы уже в индексе, то нет смысла. Если еще не в индексе, то можно (с 301-ми редиректами).
Вот тут для крупных сайтов показывается доля - https://ru.megaindex.com/a/rating
Например, убрать дублирование дескрипшенов и кейвордс. А также наполнить разделы, чтобы не было разделов с одним объявлением.
Не до такой степени, чтобы об этом думать. Но вообще - да.
Те, которые вы привели - это тоже коммерческие.
А вот эти:
Некоммерческие.
Я имел ввиду не добавлять к анкору URL, а заменять его урлом, названием компании и т. д.
Ну так все правильно вам написали. Надо к таким анкорам добавлять анкоры с URL, с названием компании, с непродвигаемыми словами, чтобы не все анкоры служили для продвижения запросов, а были бы еще и анкоры для разбавления.