У меня такая обрезка списка наблюдается по запросам с городом, если вводить запрос без города, то вроде все нормально.
Видимо, починили. По крайней мере ушли запросы с левыми городами. А сами запросы в списке и их частотности стали больше похожи на картину, которая была до сбоя.
Подтверждаю неадекватность Вордстата. Например, выставляю регион "Казань", ввожу запрос [пластиковые окна]:
в списке запросов нет запросов с Казанью, зато есть, например, запрос [окна пластиковые уфа] с неадекватно высокой частотностью для Казани.
С другими запросами похожая ситуация.