У меня тоже такое произошло, только 3 недел назад.. сегодня проиндексировал объекты каталога "жирного" (цитата), а саму страницу каталога, буд-то не заметил...
под основные запросы яша предпочел, внутренние страницы...
Кстати, про выброс категории, есть предположение, что это из-а переоптимизации может произойти, проверьте на количество вхождений ключей, сравните с конкурентами... Мне так один из разделов удалось вернуть.. Я урезал количество разного рода вхождений по ключам в 3 раза, помогло, страница сразу стала релевантной и яша ее принял, с хорошим подъемом...
У меня тоже самое, поправил некоторое время назад адрес раздела каталога, объекты которого занимают добрую половину сайта... вот теперь сижу и жду... уже недели 3 съесть не может новый урл...
Касательно выпавших страниц - выпали, процентов 60, тоже никак не вернутся!
