Поисковые системы умеют отличать типовые элементы (шапку, футер, меню) от контента и учитывают их соответственно.
В вебмастере достаточно подробно описано как Яндекс формирует быстрые ссылки. Ориентируйтесь на рекомендации Яндекса.
Попробуйте подойти к проблеме с другой стороны. А пользователям (посетителям) сайта данная ссылка будет полезна? Им нужен данный товар в розницу? На сайт приходят посетители, которые не интересуются оптом?
Под генерацией фильтром ссылок, Вы, видимо, подразумеваете "умный" фильтр, который создаёт некоторое количество страниц с ЧПУ.
Для продвижения подходят оба варианта, но второй более трудозатратен для контент-менеджера (человека, который будет заполнять сайт и создавать разделы), а первый - для программиста (создание и настройка фильтра).
Наверное, для большого магазина, корректно настроенный автоматический фильтр, создающий страницы будет лучше.
Если сам перевод уникален, то он будет считаться уникальным. По сути любой текст, который проходит проверку на уникальность в специальных сервисах (например, https://content-watch.ru/text/) будет считаться уникальным, вне зависимости от тематики.
Покажите пример адреса который нужно закрыть (желательно пару) и пример адреса, который нужно оставить открытым для индексации.
Слишком мало данных для ответа. Поддомены одной тематики? Какие Вы хотите покупать ссылки (вид и тип ссылок)?
По данному запросу этот сайт в топе только у Вас был? Вы не думали, что это может быть индивидуальная выдача Яндекса? Почему Вы решили, что это результат ссылок, если сайт был под фильтром?
Особенно обидно будет, когда потратишь на развитие акка, а тебя за крауд забанят
Если ПС обнаружит попытку манипуляции выдачей с помощью ссылок, то от фильтра плавность Вас не спасёт.