Вместе с этим сообщением должно выводиться «Пожалуйста, завершите шаги установки. Чтобы создать новую сеть, нужно очистить или удалить таблицы сети в базе данных».
Алгоритм полной очистки:
1. Удалить таблицы:
wp_blogs wp_blog_versions wp_registration_log wp_site wp_sitemeta wp_signups wp_sitecategories (если есть)
2. Удалить строки, добавленные при создании сети в wp-config.php.
3. Изменить правила в .htaccess на правила для обычного WordPress. Как вариант, можно пересоздать их странице «Параметры» > «Постоянные ссылки», нажав кнопку «Сохранить изменения».
4. Удалить два поля, добавленные в таблицу wp_users: deleted и spam.
Предполагаю, что для повторного создания сети достаточно первых двух пунктов. И нужно не забыть добавить define('WP_ALLOW_MULTISITE', true); после второго шага.