попробуйте rsync
и в обязательном порядке внести исключение для phpmyadmin.
если ломанут, то в 99 случаях из 100 это смогут сделать, есть ли на сервере сухосин или нет его. попробуйте включить логирование сухосина.
качайте базу MaxMind и потрошите
у clamav базы слабенькие, детектит не все далеко. не забудьте поставить только резидентную часть на сервер.
а что вы еще хотели от нуленой версии...?? покупайте лицензию.
nslookup site.ru и nslookup site.ru ns1.site.ru совпадают ?
проблемы могут случиться везде. думаю, лучше искать вам либо хостинг хороший, либо компанию, где по VPS помогают по мелочи, например FastVPS.
в логах ошибок пусто.
верно. на форуме пишут, что скрипты нужно перекодировать под php5.3 .