Прежде чем писать в Гугл и Яндекс сделайте два действия ниже:
1. Надо почистить локальную машину от троянов. Скорее троян увел пароли FTP с вашей локальной машины и заменил файлы дистанционно, чем взломали хостера.
2. Когда не работаете над сайтом, отключайте в панели хостера возможность заливки файлов дистанционно.
Дело в том, что скрипт работает автоматически и если вы не предпримете мер безопасности, он опять зальет вам ту же гадость, даже если вы поменяете пароль FTP
