Интересная тема. Неплохо было бы все же выяснить причины разных позиций.
Я давно замечал, что в гугле позици на рабочем компе и на домашнем несколько отличаются, но придавал этому особого значения.
Сложно ответить, но думаю лучше не спешить.
Для своего сайта я уже указал регион - жду результатов.
Уверен, что можно вывести по разным ключевыкам (если это разные страницы). Тем более пластиковые окна и ноутбуки вполне могут продавать в одном месте (если это портал с разными отделами например).