Пока ждите, если за полторы - две недели результата не будет - пишите в тех. поддержку.
Живой трафик сейчас наилучшая рекомендация для индексации в Я.
Если с историей домена всё в порядке, проблем быть не должно.
Привяжите Я.Вебмастер с Я.Метрикой, дайте живого трафика. Задержки в несколько дней бывают, но в целом в течении недели - двух должен быть первичный индекс.
Сколько страниц сайта открыто для индексации?
Содержание страниц?
