Влияет если ссылка начинается с ним, в вашем случае /xxxx/?sid нет.
Disallow: /*?
У чпу нет "смысла".
Вообще это может создать дубли страницы.
http://www.google.ru/search?hl=ru&newwindow=1&client=opera&hs=uKI&rls=ru&q=Error%3A+Can%27t+connect+to+local+MySQL+server+through+socket+%27%2Fvar%2Flib%2Fmysql%2Fmysql.sock%27+%28111%29&oq=Error%3A+Can%27t+connect+to+local+MySQL+server+through+socket+%27%2Fvar%2Flib%2Fmysql%2Fmysql.sock%27+%28111%29
Ну так сервер запущен.
Start mysqld: http://nixcraft.com/centos-rhel-fedora/14534-restart-mysql-centos-server.html
mysql вообще установлен на сервере?
service mysqld status
Вот из первой десятки
service mysqld start
RXS, не знаю, врядли вы на этом форуме про него слышали, но есть такая штука называется поиск. Если подумать и задать в нем правильно "вопрос" можно быстро получить ответ http://www.google.ru/search?hl=ru&newwindow=1&client=opera&hs=nhw&rls=ru&q=%D0%BA%D0%B0%D0%BA+%D0%B7%D0%B0%D0%BF%D1%83%D1%81%D1%82%D0%B8%D1%82%D1%8C+mysql+%D1%81%D0%B5%D1%80%D0%B2%D0%B5%D1%80&oq=%D0%BA%D0%B0%D0%BA+%D0%B7%D0%B0%D0%BF%D1%83%D1%81%D1%82%D0%B8%D1%82%D1%8C+mysql+%D1%81%D0%B5%D1%80%D0%B2
Так обращения, или переходы с гугла? Код ответа в логах какой? Страницы где, в кэше пс, на сайте? Можете написать хоть какую-то конкретику.
У вас файлы оттуда доступны публично? Если нет, и он там был, то это был файл из публичной директории который тянул данные оттуда. Хотя я сильно сомневаюсь в этом. Скорее всего дорвей был друпале которого вы снесли.
В принципе лучше обратится к специалисту, или почитать одну из многочисленных тем этого раздела про взломы и поиск, потому что если там вирус если там вирус искать можно долго.
В принципе.
Однозначно, пост в капилку http://blgo.ru/blog/2009/04/22/forums/
Спалю наверное тему, здесь (на форуме) тоже есть быстро робот.