Спасибо за наводку... rel alternate - не настроен вообще. Точнее он настроен только для того, чтобы указать мобильную версию сайта...
Дело в том, что домены вот такого вида и нужен ли alternate ..
http://www.workwebsite.ru/joomla/modules/obratnaya-svyaz-joomla.html - может это подойдет.
