Soft 2006 помоему оптимальный вариант, они ж впринципе отличаются только версиями ПО, а больше вроде и ничем.
Посмотрите как выводяться записи в шаблоне категорий (category.php), потом сравните их с главной страницей (index.php или home.php, взависимости от шаблона), думаю найдете отличия:)
А в рубриках у Вас все нормально переключает, плагин здесь не при чем, попробуйте посмотреть, как будет работать на стандартной теме.
Для рубрик я вручную прописывал в header.php пропишите:
<?php if(is_category('ID')) { ?><meta name="keywords" content="ключевики"><?php }?>, а вот для тегов не знаю:)
ID - Идентификатор рубрики, если включено ЧПУ в настройках рубрик посмотрите.
Главное не забудьте сделать бэкап файлов и базы данных и можете смело приступать к обновлению, перед тем как обновлять отключите все плагины, так как они могут быть несовместимы.
Почему тогда поисковая система?:)
А выдача там очень выдачу Яндекса напоминает...
<?php bloginfo('name'); ?> берет значение из параметра Заголовок блога, который находится в общих настройках, а <?php bloginfo('description'); ?> из параметра Краткое описание, которое находиться там же, если оно не выводиться значит оно у Вас пустое.
А в настройки файрвола смотреть не пробовали?
Попробуйте CyStats (http://wordpress.org/extend/plugins/cystats/), у меня на 2.8 отлично работает. Руссификатор можно скачать здесь http://mywordpress.ru/plugins/cystats/