Если виртуалки выключать нельзя, то это единственный вариант - поднять минимальную скорость и держать руку на пульсе.
Но почему LA был двухзначным при том, что VPS особо ничего не делают - для меня загадка. Разумно ожидать повышеный WA из-за синхронизации, но ... Посмотрите iotop еще, может что-то неприятно грузит диск и мешает синхронизироваться быстро.
Можете пояснить что означает "не имеется возможности"?
Можно поднять нижний предел скорости синхронизации, чтобы быстрее ее добить.
Как уже советовали - смотрите в логи, но у меня такое ощущение, что не стоит mcrypt.
Учитывая, что это хецнер вероятность того, что полетел диск процентов 80 :)
Уточнить у ДЦ что видно на экране когда он повис. Возможно kernel panic.
Быть может в ДЦ проблемы с питанием, из-за чего серверу иногда сносит башню, но с этим достаточно сложно бороться.
Рекомендую fio. Получите вполне адекватный ответ.
На эту тему на хабре была хорошая статья - http://habrahabr.ru/post/154235/
Попробуйте включить модуль:
modprobe ip_nat_ftp
Может заработает, но нет уверенности, что он отслеживает подключения на нестандартном порту.
Если это действительно Hetzner, то для них не проблема даже при указании серийного номера сбойного диска под замену в итоге вынуть оба и вставить ОДИН новый.
dakter, создать location и добавить в него директиву flv либо mp4 можете? Даже в документации на wiki.nginx.org есть пример.