В крупных городах больше трафика, но выше конкуренция, в маленьких городах меньше конкуренция, но и трафика меньше. Выберите сначала несколько целевых городов и занимайтесь по ним детальной проработкой. Для остальных внутреннюю оптимизацию по шаблону сделайте для начала.
Сайт клиентский или личный? Какая модель получения прибыли?
Есть платный сервис - Мутаген. Из бесплатных можно использовать формулы KEI в Кейколлекторе, основанные на показателях выдачи Яндекса
Запрещать так же, как запрещается все в robots.txt - через disallow. Посмотреть, какие страницы в папках типа /includes/ нужны, а какие нет. Исходя из этого запретить или всю папку, за исключением отдельных страниц (которые допустить к индексу через allow) или отдельные страницы.
1. Можно, но нужно ли?
2. Анкорная составляющая важна. Сам вес с англоязычных доменов передаваться будет, но вот прокачка по фразам через анкоры нет, и автоперевод яндекса тут никакой роли не играет.
Насчет ТИЦ не знаю, а по поводу индекса сайтов на WIX вот почитайте
Нет, H1 разный для разных страниц. Для каждой страницы свой
Например некоторые цмски добавляют к урлу товаров название категории, и если товар находится в 2 категориях получается один товар, доступный по 2 урлам, с полностью идентичным содержимым. То есть site.ru/category1/product1 и site.ru/category2/product1
H1 должен появляться автоматом на странице, без необходимости отдельного ручного прописывания (но с возможностью ручной правки). Шаблоны метатегов делаются на те же товары, для которых требуется подстройка метатегов под товарные запросы и уникализация таких страниц. Это опять же не ручное прописывание, а автоматическое, при условии работающего шаблона.
Есть текстовая релевантность, есть ссылочная, есть георелевантность, когда страница соответствует одному региону, но нерелевантна другому. Если пагинация выходит в выдаче в одном регионе, значит для него она по каким то причинам более подходит.
Простые и эффективные методы решения все перечислили, так что если для вас пагинация не является важной, то лучше воспользоваться одним из этих способов и не париться.
А что в яндекс вебмастере, никаких санкций все еще нет? Некоторые тексты очень для Баден-Бадена подходят
Нужно видеть сайт и запрос, без них ситуация непонятна. Георелевантность просто так не скачет, значит есть влияющие факторы, если это не разовый глюк.