Вам необходимо корректно настроить параметр rel="nofollow" и проблемы не будет такой.
Нужно 2 А записи чтобы было.
Первая в хосте пишется "@", вторая "www":
В DNS редакторе указываете в качестве A-записи IP сайта.
Надежность работы сайта зависит от хостера в первую очередь, в частности если будет сменен IP на хостинге то и в DNS записи IP нужно вовремя сменить (нормальные хостеры присылают вовремя уведомления о смене IP).
То-есть, DNS оставить яндексовские - самый надежный вариант (при проблемах у хостера почта будет приходить)
Пишите так:
Disallow: /*?p= Disallow: /*?u=
Если все сводится к этому разделу, то прятать ее уж точно не следует.
Бекап сделайте перед обновлением, и обновляйтесь (а бекап для спокойствия - если пойдет что-то не так).
Не нужно открывать их индексацию. Индексацию открывать следует только на те страницы где для вас приемлема "точка входа" посетителей. Если отчеты не являются целевой информацией для посетителей, то открывать не стоит.
Если же в отчетах есть в потенциале информация которую могут искать посетители, то в таком случае следует разрешить индексацию.
Второй вариант.
Нужно чтобы было все правильно настроено, и тогда склеится все.
У вас точно настроен правильно robots.txt для: www.site.ru и site.ru? (когда речь идет о склейке, нужно чтобы все настроено было корректно с www и без)
Если у вас при открытии site.ru показывается тот-же контент что и на сайте site.com, то это значит что ваш site.ru припаркован к site.com
Если у вас при открытии site.ru/robots.txt в Host прописан site.com, то необходимости в 301-м редиректе нету как таковой (А если сделаете редирект, то даже лучше будет и более понятней для посетителей).
Поисковики склеют site.ru с site.com в недалеком будущем.