Выбор сервера под MySQL

Производительность ФС зависит от рабочей нагрузки и тут нельзя выдать конкретный рецепт.

Но можно привести некоторые примеры.

Например восстановление после сбоя, а конкретнее - низкая производительность при работе с каталогами в которых очень много файлов. В этот пример попадают ext2, ext3 (хотя тут все стало немного получше)

Я бы выбирал файловые системы с журналированием, иначе проверка ФС после сбоя может неплохо затянуться. Это может быть ext3, XFS, ZFS, JFS или ReiserFS.

Время монтирования ФС, если у вас терабайты данных. ReiserFS в таком случае долго монтируется и восстанавливается.

Например у ext3 есть различные режимы журналирования, и включения каждого из них имеет свои плюсы и минусы (в разрезе движка InnoDB).

writeback - журналирует только изменения метаданных. Считается самой быстро конфигурацией для InnoDb, так - как изменения мета данных не синхронятся с записью инфы.

например режим journal, где данные сначала пишутся в журнал и только потом в место назначения, как правило, это излишне.

ну и т.д.

Можно тюнить много чего, чтобы дать прирост InnoDB. Например отключение регистрации времени последнего доступа, упреждающее чтение.

Если юзать LVM (например резервные копии) хорошо бы посмотреть что нет траблов у ФС и они хорошо "дружат".