Почему может пргон по каталогам повлечь ухудшение индексации и позиций

если сайт не молодой то ничего бы не было. причина в другом.

В том и дело - сайт молодой.

Тогда меняется вопрос с "почему может" на как теперь исправить?

Прогон по каталогам (как и вообще любой массовый прирост некачественных ссылок) давно не актуален и ведёт к понижению позиций. Особенно для молодых сайтов. Я с этим столкнулся ещё пару лет назад, больше этой ерундой не занимаюсь. Даже статью тогда написал на эту тему.

То есть сейчас остаётся лишь ждать, пока не качественные ссылки не отвалятся а число качественных не увеличится?

Зачем ждать? Сами постепенно число качественных ссылок увеличивайте.

NoteBoard.ru, я не буду поддерживать что каталоги плохо или хорошо. Вот только скажите сколько ссылок у вас появилось после прогона?

Зачем ждать? Вы сайт создавали для прогона по каталогам или для чего-нибудь другого? Делайте сейчас "что-нибудь другое", наполняйте и забудьте на полгодика (если сайт молодой) вообще о том, что такое ссылки и т.д.

А насчет прогона по каталогам... Представьте себе, что вы наблюдаете некий сайт. И этот сайт, едва вылупившись - тут же оброс несколькими тысячами ссылок, из которых тематических - единицы. ЧТо бы вы сами сказали о таком сайте?

По яндексу 3к ссылок.

Собственно с тем сайтом и делается то, для чего он был создан.

Постепенно набирается число постоянных посетителей, то есть всё идёт своим чередом.

Печалит другое: уникальный контент, который туда выкладывается уже начали оттуда предприимчивые "вебмастеры" копикрасть и их страницы с этим контентом оказываются выше в выдаче.

То, что естественным путём ссылочная масса увеличится это факт, но с другой стороны, стоимость домена как бы намякает, что может и не нужен уже такой домен, если вариант только один - "ждать" и нет никаких вариантов обратить ситуацию с уже имеющимися ссылками из зла в благо.

Лично я бы сказал, что этим сайтом занимаются, а раз так, значит это не бесхозный сайт аля "домашняя страничка моего кота Кузи а я учусь в 5-м классе", но конечно это я, а не Я и не G, ещё бы я смотрел по контенту, если он действительно уникален и полезен, то домножил бы ссылочную массу на -1, то есть обратил бы во благо, но вероятно у Я нет в интерфейсе контролёров кнопки "домножить на -1" для данного случая, потому как переговоры с Платоном ни к чему не привели.

Все это случилось по причине криворукости и незнания прогонщика, только и всего...

Посмотрите уникальность контента на морде как минимум... и запомните, что больше 700 белых каталогов не бывает

А может проблема как раз не в прогоне а в возрасте?

ИМХО 3к ссылок, половина из которых отвалится (и вы сами этого ждете) это глупо - нахрена так делать-то? не лучше ли 500, которые не отвалятся? Логичнее и, наверное, дешевле... (мб у вас будет небольшая польза для гугла, но для многих тем трафик с него не коммерческий идет и не конверсионный)

А про возраст, если тема коммерческая и конкурентная то по СЧ запросам - до года можно вообще ничего не делать, штук 100 немигающих бэков вполне хватит, жать лучше не на позиции а на контент и трафик (и, увы, директ). Если конкурентный ВЧ, то и больше года за позициями лучше не гоняться.

Если говорить про трафик, то даже нихрена не делая (оставив все как есть с учетом того, что все ваши 3к бэков не вылетят и останется хотя бы 300) можно наблюдать как он растет в течении первого же года, причем здорово.

Каталоги тут не виноваты, вы зря ждали что позиции вверх попрут - прогнали бы 3хлетний сайт по тем же каталогам, скорее всего получили бы пюсы по позициям.

ИМХО, хорошие люди, по ряду причин вряд ли будут заниматься прогонами, а "авторитетность" на форуме это ваще песня отдельная...