Большое количество внутренних ссылок с морды

На PR повлияет, на тИЦ нет

Не совсем понял вопрос, но отвечу на то, что понял :) Ссылки с главной на внутренние страницы на тИЦ не повлияют, тИЦ рассчитывается для всего сайта в целом и влияет на положение сайта в Яндекс.Каталоге (а оно Вам надо? ;) ). На PR внутренних страниц ссылки с главной повлияют.

впринципе что хочу узнать:

уменьшив в два раза количество ссылок с морды на внутренние страницы, повысятся ли позиции сайта по ключевой фразе в выдаче яндекса и гугла?

Если опираться на теорию - позиции останутся такими же.

На практике - всякое может быть.

а может есть смысл внутренние ссылки заключить в <noindex> ?

А чего этим добится то хотите ? В увеличении передаваемого PR внутренним это не поможет. А Яндекс вообще не будет их индексировать.

Позиции этим Вы не увеличите.

если уж сильно приспичило - анализировать скриптом user-agent и отдавать главную страницу с этими ссылками или без - по потребности. Это, кстати, слабое место при обмене ссылками, imho. Хотя.. всегда можно проверить индексацию ссылки в самом поисковике - лениться просто не надо.. 😎

Значит - пилить сук, на котором сидите ...

Здесь нечего переживать, все ОК!

Для главной разницы не будет!

У-у, совсем клоакинг какой-то получается. не надо так делать! во всяком случае, не стоит такое советовать.

А что касается "лениться" - многие оптимизаторы частенько ходят под юзерагентом яндекса :)

У меня есть сайты, которые имеют по 40 на морде, кроме нормального увеличения PR внутренних, побочных эффектов не заметил :)