Есть ли понятие пессимизация у яндекса или нет

Есть.

Пиши Платону.

Неучет внешних ссылок на сайт.

И за что может быть наложенно такое наказание и как с этим можно бороться?

Например, за линкопомойки на сайте.

Как бороться, я уже писал. Удалять причину и писать Платону.

Последнее время с сайтом велся достаточно большой объем работ, я думал может переборщил.

Но к счастью вечером сайт вернулся на прежние позиции по своим СЧ запросам.

Но все равно целый день его в поиске не было.

ещё может быть пессимизация за большое количество дубликатов внутри сайта. (вследствии кривых рук программиста или движка)

А если нет не каталога не дублированного котента. Сайт раньше был копипаст, теперь много переписанно. На сайт два месяца назад, в течении месяца покупались дорогие тематические ссылки, теперь он по ссылочному бюджету обходит большинство конкурентов. Сайт не виден в поисковой выдаче или виден на 300-500 позициях по средне и низкоконкурентным запросам. На запросы Платоны отвечают, что сайт ранжируеться в соответсвии со своей релевантностью.

Другой сайт тойже тематики с такимиже характеристиками, при меньшем бюджете легко вошел в 20.

Что делать с первым сайтом не знаю, может кто чего посоветует.

вы конкурентов поймали и выпытали у них бюджет ?

Что кроме пыток нет методов определения приблизительного бюджета конкурентов?:)

Аналогичная ситуация у меня. Трафф резко с яндекса упал. Думаю из-за продажных ссылок в сапе. Убрал - отписал Платону. Жду ответа