Как запретить индексировать дублирующиеся страницы со знаком вопрос?

Ну а как вы хотели, если вы на каждой странице подсовываете в ее коде короткую ссылку ( shortlink )на ровне с основной. У вас же WP, уберите из кода весь мусор, ленты, генератор, короткую ссылку и тд руками или любым плагином очистки этого всего.
Плагинов под удаление этого достаточно, тогда не будет индексить, иначе ничего не поможет.

Ещё и ты вредные советы начал раздавать.. :(

shortlink  может и индексируется (я не в курсе), но в выдачу не попадает. Как минимум этому мешают 301 и каноникал (если там ВП).

https://www.seonews.ru/events/kak-google-obrabatyvaet-ssylki-s-atributom-rel-shortlink/:

Ничего удалять не нужно, а хлам - это как раз подобные плагины.

Если это попало в выдачу, то скорее всего эти ссылки где-то в явном виде прописаны.

😀 если человека нервирует проблема или тревожит, есть смысл от нее избавиться, тем более действительно короткие лезут в индекс ( кроме гугла есть и другие поисковики) . Убрать сниппетом и забыть, но как вариант плагин,  он если не что-то глобальное, а именно сборник нескольких функций, которые очистят, совершенно безобиден. Ресурсов не жрет))

remove_action( 'wp_head', 'wp_shortlink_wp_head' );

вам бы определится кто и где кого индексирует 

покажите скрин где поисковики индексируют

Думаю тот случай, когда ожидаемые опасения опережают реальность :)

Для начала нужно точно узнать источник проблем, а не грешить на первое похожее. Иначе может быть только хуже.

Дело даже не в ресурсах. Дело в бесполезности этих телодвижений в принципе и вредности подобных советов.

Очень сомневаюсь что лезут именно  шортлинки. Особенно если каноникал прописан. (у меня же этого нет, хотя сайтов я позапускал и анализировал...)

Думаю ТС не углублялся в тему, за него... могут пс выдавать в разных ситуациях короткую. Надо не забывать, что она в WP передается в заголовке, проверить просто через консоль браузера "Сеть".

Поэтому лучше убрать и забыть.

Так там на сайте стоит Woo, еще какие-то плагины, которые короткими ссылками оперируют в своих функциях, наверно появляться где-то на страницах. Поэтому пс и подхватывают. Но тут уже надо самому ТС анализировать и корректировать разными способами. Каноникал даже гуглу не указ давно, подхватит то, что посчитает нужным или...;)

В принципе, все, что потенциально не нужно в коде, зачем оно там, а лишнего, я считаю, больше десятка. Опять же мое мнение и я удаляю. 😎

НИГДЕ НИКОГДА короткие ссылки не появятся ни на одной странице если самостоятельно их не проставить. Или не накосячить в самописьках.

...при включённых ЧПУ разумеется..

Яндекс знает всё (С).
Особенно то, что указано в исходном коде страницы.
Но не надо бояться того, чего не случилось и не должно случиться.