Как вывести содержимое файла

Суть в том, чтобы в попандере тянулись ссылки из другого файла если это все будет в одном лендинге.

Ну и вписываете другой файл. Какие проблемы?

Постараюсь более понятно объяснить. На лендинге php скриптом тянутся ссылки с файла links.txt

<?php

$file = file(__DIR.__'/links.txt', FILE_IGNORE_NEW_LINES | FILE_SKIP_EMPTY_LINES);
$url = $file[mt_rand(0, count($file)-1)];

if (isset($_GET['subid1']) && $_GET['subid1']!='') {$url.='&s3='.$_GET['subid1'];}
if (isset($_GET['click_id']) && $_GET['click_id']!='') {$url.='&click_id='.$_GET['click_id'];}
?>

И если в футере я добавлю еще скрипт попандера

<script type="text/javascript">
var popunderPeriod = 12;
var popunderUrl = '<?=$url?>'; </script>
<script src="https://akamaized.net/mr/popunder.js"></script>

То по всему лендингу будет одна и та же исходящая ссылка,как в теле лендинга, так и в попандере, а задача состоит в том, чтобы ссылка с попандера была другой, соответственно тянулась из другого файла.

Ну так поставьте другую ссылку, с другого файла, какие проблемы?

Чего тут может быть непонятного?

$file2 = file(__DIR__ . '/links2.txt', FILE_IGNORE_NEW_LINES | FILE_SKIP_EMPTY_LINES);
$url2 = $file2[mt_rand(0, count($file2)-1)];

и ниже по коду

var popunderUrl = '<?=$url2?>';