Яндекс не ранжирует сайт в поиске, а в Google сайт в топе

В базе Яндекса: 15К страниц

Наложив данные метрики нашел 3,5К страниц, которые с 01/01/2020 никто не посетил и 1,5К страниц, на которые был 1 заход.
Среди них много архивных товаров. Видимо, с них и стоит начать удаление...

Только предварительно через тот же вордстат проверьте запросы по товарам/линейкам/производителям. А то может товары и нужны, только ваш сайт никто не видит, поэтому и заходов 0.

1,5К архивных товаров, частотность 0, заходов 0.

Неожиданно много.
Убирать сразу столько, видимо, тоже не следует (1,5К из примерно 13К товаров).

Если вы действительно уверены что эти 1.5к уже никому никогда не будут нужны - через ЯВебмастер отправляйте по 500 урлов на удаление из поиска, а потом уж и физически удаляйте.

Не забудьте проверить поисковую видимость этих товаров. Проанализируйте показы их поисковой видимости по вебмастеру.

Если нет частотности, нет показов и нет трафика, то такие товары можно удалять.

А скажите, это у всех в вебмастере такое уведомление висит при попытке посмотреть внешние ссылки? уже больше года данные о ссылках не обновляются( 

Скриншот https://prnt.sc/26nycbh

Да

не известно когда данные начнут обновляться?

Недавно задавали этот вопрос Янексоидам. Ответ - пока сроки не обозначены. 

Так что в процессе, ясных прогнозов пока нет.

Зачем оно вам? У Яши ПФ в приоритете, а не ссылки.