Привет, Ваня. Moyhosting.com рулит!

А время создания директорий в ../domains/ и самого аккаунта равны?

В директорию распаковуется папка domains. В бек-апе есть 2 директории: domains и backup. Вот в domains - иерархия и в ней хранятся все сайты и файлы и в результате хотите сказать, что папки перенесли и ювелирно вырезали файлы? Не верю. В Backups - конфиги и базы.

Я хочу сказать другое..

Если директории для сайтов созданы после входа пользователя в ДА.. а не когда создавался аккаунт.. может у пользователя не все заработало (допустим потерялись юзеры от баз) и он решил пересоздать сайты.. вот и стало пусто.. ))))

Во время перноса сайты работают на 100%. Сайты переключаются на новый только тогда, когда мы убеждены, что сайты перенеслись.