На трех сайтах (ДЛЕ 9.6) также исчезли записи в блоке "популярные новости". Полез в код, обнаружил, что там почему-то идет привязка к дате новостей и если сайт не обновлять, через определенный период в модуле ничего не будет выводиться.
$arr = array("http://www.", "http://", "www.");
$url_site = str_replace($arr, "", $url_site);
Это же не критическая ошибка, а просто предупреждение, не стоит беспокоится.
Было такое при просмотре старой темы из архива.
Попробуйте get_url($category_id)
У меня тоже обычно около 6 файлов в этой папке, установки в админке стандартные. 50 файлов это что-то очень много.
Поместить в эту папку другой htaccess
А зачем здесь редирект? Просто в robots.txt закройте от индексации дублирующие страницы.
Хотя бы чтоб уникальный контент был.
Все-таки проблема наверно в сайте или хостинге.