Там где хорошо :)
Хорошо там, где нас нет. (С)
ИМХО, если человек начинает работать с шаред.хостингом, особенно если с vds/dedic, то нужно ставить вторую ОС из семейства Unix/Linux, и с нее работать, тем более все средства работы, уже встроены.
По идеи 3 пункт анонимный :)
Банально с Total Commandera воруют пароли :), и очень часто, различные зловредные программы.
А если так? 🍻
http://support.hyperois.com/index.php?_m=downloads&_a=viewdownload&downloaditemid=2
Правда это для почтового модуля, но если посмотреть на офф.форуме, там думаю умельцы уже сделали.
Вот немного обсуждения
http://forum.configserver.com/showthread.php?t=501
Так же Вам может помочь вот этот firewall, комбайн с настройкми по защите http://www.configserver.com/cp/csf.html
Спасает от брута, атаками флуда на порты, установка определенного количества соединений с одного ip, а так же помогает с блокировками портов, очень полезен для тех кто не знаком с синтаксисом iptables.
Встраивается в некоторые панели, можно установить модуль для webmin. Настроек масса, установка занимает 5 минут. Очень советую.
Случайно не на Drupal такие базы? Если да, могу подсказать как уменьшить в двое
Это поисковые системы, не любят сервера в Азии, а не наоборот :)
Отправляйте ему каждый день 25 писем счастья :)